契税不同：首套房，90平米（不含）以下1%，90-144平米（不含）1.5%，144平米以上3%；二套房一律3%。个别城市首套房二套房，契税按2%和4%缴纳。
首付及利率不同：首次贷款，首付不低于30%（公积金不低于20%），执行基准利率；二次贷款，首套贷款未还清的情况下，首付不低于60%，利率上浮1.1倍，首套贷款还清的情况下，首付不低于30%，利率上浮1.1倍。
还有一个区别：要买的房子是否卖方名下唯一住房。是唯一住房，满两年免征营业税及个人所得税，不满两年，征收营业税5.6%及个人所得税1%，满两年不唯一，免征营业税，缴纳个人所得税。之所以说这个区别，是因为，规定营业税及个人所得税由卖方缴纳，但实际生活中几乎都是买方交的，卖方只是净得价卖房。首套房认定标准

1、贷款买过一套房，商业贷款已结清，再贷款买房——算首套。

2、贷款买过一套房，后来卖掉，通过房屋登记系统查询不到房产，但在银行征信系统里能查到贷款记录，再贷款买房——算首套。

3、已经全款买过一套房，再贷款买房——算首套。

4、全款买过一套房，后来卖掉了，房屋登记系统查不到房产，再贷款买房——算首套。

5、个人名下有两套房的商业贷款记录，全都已还清且出售，同时能够提供两套住房出售的证明，这种情况下再贷款时——算首套。

6、个人名下有一套房商业贷款已还清，另一套是公积金贷款已出售，同时能够提供住房出售的证明，申请商业贷款再买房——算首套。

7、夫妻两人，一方婚前买房使用商业贷款，另一方婚前购房用的是公积金贷款，婚后两人想要以夫妻名义共同贷款。若贷款已还清，银行业金融机构可以根据借款人偿付能力、信用状况等具体因素灵活把握贷款利率和首付比例。

8、夫妻两人，一方婚前有房但无贷款记录，另一方婚前有贷款记录但名下无房产，婚后买房申请贷款——算首套。分析如下：

首套房：是指购买仅拥有一套住房（以国家对首套房的的认定标准）。中国人民银行规定我国城市居民购买第一套住房享有按揭贷款利率优惠和最低首付比率等优惠政策。

首次购房的判定标准：

①买房人年满18周岁

②买的房子是90平方米及以下的普通住房（90平方米及以下的普通住房是享受契税税率1%的优惠）；

③购房人名下没有单独或与他人共同购买的住房。不过与父母一起购买的、按照房改政策购买的、通过继承遗产或拆迁安置获得的住房除外。

二套房:是第二套普通自住房的简称，是指以借款人家庭（包括借款人、配偶及未成年子女）为单位认定的，借款人家庭人均住房面积低于当地平均水平的，再次向商业银行申请住房贷款的房贷房。

新出台的二套房标准是以家庭为单位，既认房又认贷，且异地人士购房贷款还需提供1年以上拟购房地的纳税证明或社会保险缴纳证明，否则均按照二套房贷计算。